As equipes parecem estar divididas em X-Force, formada por Cable, Arcanjo, Psylocke, Mancha Solar e Jubileu; X-Corp, formada por Fera, Jean Grey, Ciclope e Polaris; a equipe do Egito Antigo traz Vampira, Noturno, Bishop, Magneto e, também, Fera; e, por fim, a X-Factor, que inclui Havok, Polaris, Fortão, Lupina, Homem-Múltiplo e Val Cooper.
A produção continua logo após os acontecimentos do último episódio da animação original, onde o Professor Xavier deixa a Terra, com os X-Men acreditando que ele morreu, e Magneto se comprometendo a guiar os mutantes.
A primeira temporada contou com a aparente morte do Gambit, derrotando o Sentinela em Genosha num capítulo que impactou a internet, além de terminar com o Wolverine em estado crítico após confronto com o Magneto. No fim, porém, foi sugerido que Gambit estaria voltando como um dos Cavaleiros de Apocalipse, o icônico vilão dos X-Men e primeiro mutante do universo Marvel.
Tanto a série clássica quanto X-Men 97 estão disponíveis no Disney+. A segunda temporada estreia ainda em 2026.